Profil Sekuen Internal Transcribed Spacer (ITS) Mangifera pedicellata Konterm. Vak XXIV.A.156 Koleksi Kebun Raya Bogor

Arrifatuzzahroh, Arrifatuzzahroh (2025) Profil Sekuen Internal Transcribed Spacer (ITS) Mangifera pedicellata Konterm. Vak XXIV.A.156 Koleksi Kebun Raya Bogor. Diploma atau S1 thesis, UIN Sultan Maulana Hasanuddin Banten.

[img] Teks
S_BIO_201710036_Cover.pdf

Download (131kB)
[img] Teks
S_BIO_201710036_Lampiran Depan.pdf

Download (2MB)
[img] Teks
S_BIO_201710036_Bab I.pdf

Download (217kB)
[img] Teks
S_BIO_201710036_Bab II.pdf

Download (149kB)
[img] Teks
S_BIO_201710036_Bab III.pdf

Download (330kB)
[img] Teks
S_BIO_201710036_Bab IV.pdf

Download (445kB)
[img] Teks
S_BIO_201710036_Bab V.pdf

Download (8kB)
[img] Teks
S_BIO_201710036_Daftar Pustaka.pdf

Download (330kB)

Abstrak

Tumbuhan Mangifera pedicellata termasuk ke dalam genus Anacardiaceae. M. pedicellata berasal dari daerah Sulawesi. Tumbuhan ini dikonservasi di Kebun Raya Bogor (KRB). Penelitian molekuler tanaman M. pedicellata penting dilakukan karena belum ada yang melakukan penelitian mengenai molekuler DNA M. pedicellata berbasis ITS sehingga penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi profil sekuen ITS M. pedicellata dan kekerabatannya dengan speises lain yang berada di NCBI. Penelitian ini dilakukan pada bulan Januari- Desember 2024. Sampel M. pedicellata diambil dari koleksi Kebun Raya Bogor (KRB). Penelitian ini menggunakan metode CTAB dengan tahapan meliputi pengambilan sampel, ekstraksi DNA, proses PCR, elektroforesis, sekuensing, dan analisis data hasil sekuensing. Sekuen DNA gen ITS pada tumbuhan M. pedicellata mempunyai sekuen 900 bp dan menghasilkan pita DNA tunggal, serta mempunyai komposisi nukleotid T(U): 20,4%, C: 32,9%, A: 16,2%, G: 30,3%. Hasil BLAST menunjukkan homologi tertinggi pada M. quadrifida dengan nilai 96,64%. Analisis pohon filogenetik menggunakan metode Neighbor Joining dengan model kimura 2- parameter dan nilai boostrap 1000 ulangan menunjukkan bahwa M. pedicellata berkerabat dekat dengan M. quadrifida karena berada pada cabang yang sama dengan boostrap 83%. Jarak genetik M. pedicellata dengan M. quadrifida menunjukkan nilai terendah dengan nilai 0.035, sedangkan nilai jarak genetik tertinggi pada M. camptosperma yakni 1.218.

Tipe Item/Data: Skripsi/Tesis/Disertasi (Diploma atau S1)
Kata Kunci (keywords): M. pedicellata, ITS, karakteristik sekuen, filogenetik
Subjek: 500 Ilmu Pengetahuan Alam dan Mathemetics > 580 Tanaman (Botani) > 583 Magnoliopsida, Dikotil
Divisi: Fakultas Saintek > Biologi
User Penyetor: S.S.I FN H
Tanggal Disetorkan: 25 Apr 2025 03:09
Perubahan Terakhir: 25 Apr 2025 04:39
URI: http://repository.uinbanten.ac.id/id/eprint/16725

Actions (login required)

Lihat Item Lihat Item

      is powered by EPrints 3 which is developed by the Islamic Institutional Repository UIN Sultan Maulana Hasanuddin Banten. More information and software credits.